Ce site contient le matériel complémentaire pour le cours Introduction à la bioinformatique, dispensé 2ème licence en Sciences de la vie (L2 SV), Aix-Marseille Université (AMU).
Le site principal se trouve sur la plateforme Ametice d'Aix-Marseille Université, en accès réservé aux étudiants inscrits.
| Site | Contenu | Lien |
|---|---|---|
| Ametice | Gestion de l'UE, QCM, forum, ... | https://ametice.univ-amu.fr/course/view.php?id=125268 |
| Pages Web | énoncés et données des TP | https://jvanheld.github.io/intro-bioinfo-L2-SV-AMU-SSV3U15_public/ |
Note: le cours comporte 7 séance de CM. Les vidéos sont découpées par chapitres thématiques plutôt que par séances de CM.
| Chap | Titre | Vidéo | Diapo |
|---|---|---|---|
| 0 | Organisation du cours et modalités de contrôle des connaissances | SSV3U15-00 | |
| 1 | Présentation du cours | SSV3U15-01 | |
| 2 | Séquence - structure - fonction | SSV3U15-02 | |
| 3 | Du gène au génome | en cours de montage | |
| 4 | Inférence phylogénétique : retracer l'évolution à partir des séquences | SSVU315-04 | |
| 5 | Génomique personnalisée | à venir | |
| 6 | Exploration de la biodiversité | à venir | |
| 7 | Réseaux et systèmes biologiques | à venir | |
| 8 | L'information au cœur du vivant | à venir |
| TP | Titre et lien | Enoncés | Diapo |
|---|---|---|---|
| 1 | Séquence - structure - fonction | tuto/exo TP1 | |
| 2 | Du gène à la protéine | tuto/exo TP2 | diapo TP2 |
| 3 | Du gène au génome et au protéome | tuto/exo TP3 | tuto illustré TP3 Nouvelle formule ! |
| 4 | Alignements par paires et alignements multiples | ||
| 5 | Inférence phylogénétique | ||
| 6 | Variants génétiques | ||
| 7 | Systèmes et réseaux biologiques | ||
| 8 | Récapitulation, questions/réponses |
| Titre | Description | Lien |
|---|---|---|
| Glossaire | Explication des termes de bioinformatique et concepts biologiques sous-jacents au cours | html |
| Structures 3D | Figures et animations de structures tridimensionnelles de macromolécules | structures |